毛重楼叶绿体基因组共包含113 个基因，其中编码蛋白基因、rRNA基因与tRNA基因的数量分别为79、4、30个。根据其功能可以把它们分为4大类:分别是与光合作用有关的基因、复制有关的基因、未知功能的蛋白质基因，以及成熟酶基因(matK)、 囊膜蛋白基因(cem4) 等其他基因。

 

毛重楼

 

在这些基因中，有10个蛋白质编码基因(ndhB、 rpl2、 rp122、 rpl23、 rps12、rps15、rps19、 rps7、 ycf1、 ycf2)、7个tRNA编码基因. ( tmA-UGC、tmH-GUG、 tmI-CAU、 trL-CAA、 trN-GUU、trnR-ACG、 trnV-GAC) 和4个rRNA编码基因(rn16S、r7n23S、 r7n4.5S、 r7n5S) 位于R区。

 

对毛重楼叶绿体基因内含子进行统计分析，发现共有22个基因含有内含子，其中仅有4个蛋白质编码基因(ycf3、clpP、ycf1、 vcf1)含有2个内含子，其余18个基因贝有1个内含子。